Pohřben bude 9. května 1821 do neoznačeného hrobu, jehož místo si sám vybral. Vojenské pocty mu vzdá britská posádka ostrova. V roce 1840 bude jeho tělo exhumováno a převezeno do Paříže, aby dle jeho přání spočinulo na březích Seiny, uprostřed lidu, který tolik miloval.
Dodnes se vedou spory o příčinách smrti i o tom, je-li v pařížské Invalidovně uloženo skutečně tělo Napoleona Bonaparta. Thierry Lentz, přední francouzský historik napoleonské epochy a ředitel Fondation Napoléon, a Jacques Macé vydávají u příležitosti výročí knihu La Mort de Napoléon, mythes, légendes et mystères (Napoleonova smrt, mýty, legendy a záhady), jež bude střízlivým shrnutím dosud známých faktů konfrontovaných se seriozními i méně seriozními pochybnostmi. Řadu zajímavých otázek sugestivním způsobem klade historik Bruno Roy-Henry na svém webu www.empereurperdu.com.